高知大学 農林海洋科学部 大学院 総合人間自然科学研究科農学専攻

教員情報(研究者情報)

氏名

さくらい てつや

櫻井 哲也
自己紹介
生年   地域連携情報
学系 総合科学系 高知大学研究者総覧
部門 複合領域科学部門
職名 准教授
Tel 088-864-6751
Fax  
e-mail
ホームページ http://www.cc.kochi-u.ac.jp/~tetsuya.sakurai
学位 博士(農学)
専門分野 ゲノム科学、バイオインフォマティクス
研究課題 藻類など生物の網羅的情報と生命情報科学によるゲノム研究および比較解析
・生物種、系統間におけるDNAの相違と遺伝子機能や表現形質との関連性の理解
・de novo genome assemblyやRNA-seq等に基づく、対象生物の理解
・バイオインフォマティクスの観点による機能未知遺伝子の機能解明
卒論テーマとして
与えられる課題
ゲノムを主とした生命情報とコンピュータを用いた藻類、植物の遺伝子機能解析等のゲノム研究
タンパク質、表現形質情報を用いた遺伝子機能注釈、関係性の抽出
共同研究
できる課題
ゲノム塩基配列のアセンブル、DNA多型探索をはじめとする配列解析、注釈情報生産とその比較解析、遺伝子発現解析など、網羅的な情報の解析全般
講演や相談
できる課題
遺伝子機能解析
主な業績や
研究著書
Kurotani A, Yamada Y, Sakurai T. (2017) Alga-PrAS (Algal Protein Annotation Suite): A Database of Comprehensive Annotation in Algal Proteomes. Plant Cell Physiol., 58, e6
Mochida K, Sakurai T, Seki H, Yoshida T, Takahagi K, Sawai S, Uchiyama H, Muranaka T, Saito K (2017) Draft genome assembly and annotation of Glycyrrhiza uralensis, a medicinal legume. Plant J., 89, 181-194
Kurotani A and Sakurai T (2015) In Silico Analysis of Correlations between Protein Disorder and Post-Translational Modifications in Algae. Int. J. Mol. Sci., 16, 19812-19835
Kurotani A, Tokmakov AA, Kuroda Y, Fukami Y, Shinozaki K and Sakurai T (2014) Correlations between protein disorder and post-translational modifications in plants. Bioinformatics, 30, 1095-1103
Sakurai T, Mochida K, Yoshida T, Akiyama K, Ishitani M, Seki M, and Shinozaki K (2013) Genome-wide discovery and information resource development of DNA polymorphisms in cassava. PLoS One. 8(9), e74056
Sakurai T, Yamada Y, Sawada Y, Matsuda F, Akiyama K, Shinozaki K, Hirai MY and Saito K (2013) PRIMe Update: innovative content for plant metabolomics and integration of gene expression and metabolite accumulation. Plant Cell Physiol. 54(2), e5
櫻井哲也、梅澤泰史、篠崎一雄 (2011) "主要マメ科作物ダイズのゲノム塩基配列解読に貢献", 農林水産技術研究ジャーナル, 34 (4), 44-47
Sakurai T, Akiyama K and Saito K (2010) Analytical Platforms and Databases from Plant Transcriptomics to Metabolomics, Medicinal Plant Biotechnology, CABI publishing, Oxfordshire, pp.222-243
Sakurai T, Plata G, Rodriguez-Zapata F, Seki M, Salcedo A, Toyoda A, Ishiwata A, Tohme J, Sakaki Y, Shinozaki K, Ishitani M (2007) Sequencing analysis of 20,000 full-length cDNA clones from cassava reveals lineage specific expansions in gene families related to stress response. BMC Plant Biol 7: 66 Sakurai T, Satou M, Akiyama K, Iida K, Seki M, Kuromori T, Ito T, Konagaya A, Toyoda T, Shinozaki K (2005) RARGE: a large-scale database of RIKEN Arabidopsis resources ranging from transcriptome to phenome. Nucleic Acids Res 33: D647-650
研究機器等  
特記事項  
キーワード ゲノム、バイオインフォマティクス、遺伝子機能