遺伝子解析（生化学系）

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DNA Sequencer（塩基配列解析装置）

SeqStudio ジェネティックアナライザ (ThermoFisher SCIENTIFIC) NEW

アイソトープを用いずに４種類の蛍光色素を用いてサンガー法で DNAの塩基配列を解析する装置。

• 参考： DNAシーケンスの依頼について（学内専用）

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DNA Thermal Cycler

DNAの増幅反応であるPCRを自動的に行なう温度循環装置である。

	TaKaRa Dice 設置場所：遺伝子解析室1（532）
	BIO-RAD T100 設置場所：遺伝子解析室2（531）

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PCR（RoboCycler GRADIENT96, フナコシVS-4008-94SCS）

アニーリング温度の検討が出来る。専用のチューブが必要。

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リアルタイムPCRシステム（ThermoFisher SCIENTIFIC社製、QuantStudio 6 Pro) 新機器

定量PCRを行うための装置。TaqManプローブを用いた解析、SYBR Greenなどを用いたインターカレーション法での転写産物の発現量解析が可能。

• 384wellプレートの使用が可能。StepOne PLUSと同様に96wellプレートの他，8連チューブの使用も可能。（プレートの交換方法動画）
• 最低反応容量は384wellプレートで5μl 、96wellプレートで10μl。
• SYBR Green法でのMelt Curve解析の所要時間は5～7分。（StepOne PLUSでは30～40分）
• 3つのブロックゾーンで異なる温度を設定可能。（StepOne PLUSは6ゾーン）。
• 5カラーまで使用可能。

◎使用の際は機器施設HP 「主要機器の予約」 から予約してご使用ください。

※解析ソフトウェアは「Design ＆ Analysis Software」になります（StepOne PLUSのソフトウェアとは異なります）。
「解析アプリ・取扱説明書等 」 のページからダウンロードしてください（WindowsおよびMac OSに対応）。

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リアルタイムPCRシステム（ライフテクノロジーズ・ジャパン社製　StepOne PLUS)

定量PCRを行うための機器である。TaqManプローブを用いた解析、SYBRGなどを用いたインターカレーション法での検出ができる。 　最低10μlでの反応が可能である。96wellプレートの他，8連チューブなどでも 反応できる。
　Fastモードを使うことによって40分で反応を終えることが可能である。 6つのブロックゾーンで異なる温度を設定・運転することができる「VeriFlex」 ブロックが搭載されている。
　使用の際は機器施設HP 「主要機器の予約」 から予約してご使用ください。

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デジタルPCR（Bio-Rad社 QX100 Droplet Digital PCRシステム）

デジタルPCRは高精度高感度で絶対定量を行うことができます。測定にはFAM, VICラベルのプローブが必要です。 また、CNV解析、Rare sequence検出、遺伝子発現解析等に応用可能です。

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マイクロアレイ（Affymetrix社 Gene Atlas）

遺伝子発現の網羅的解析を行う。Affymetrix社製の解析ソフト群が入っている。

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