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遺伝子解析(生化学系)


DNA Sequencer(塩基配列解析装置)

担当:森澤(PHS:36735)、近藤(PHS:36732)

SeqStudio ジェネティックアナライザ (ThermoFisher SCIENTIFIC) NEW

ThermoFisher SeqStudio

アイソトープを用いずに4種類の蛍光色素を用いてサンガー法で DNAの塩基配列を解析する装置。

設置場所:遺伝子解析室(1)(5-501)

DNA Thermal Cycler

担当:森澤(PHS:36735)

DNAの増幅反応であるPCRを自動的に行なう温度循環装置である。


PCR3 TaKaRa Dice
設置場所:遺伝子解析室(1)(5-501)
PCR1 BIO-RAD T100
設置場所:遺伝子解析室(2)(5-502)


PCR(RoboCycler GRADIENT96, フナコシVS-4008-94SCS)

担当:森澤(PHS:36735)
RoboCycler

アニーリング温度の検討が出来る。専用のチューブが必要。

設置場所:液クロ室(1)(4-401)

リアルタイムPCRシステム(ライフテクノロジーズ・ジャパン社製 StepOne PLUS)

担当:森澤(PHS:36735)
Step One PLUS

定量PCRを行うための機器である。TaqManプローブを用いた解析、SYBRGなどを用いたインターカレーション法での検出ができる。  最低10μlでの反応が可能である。96wellプレートの他,8連チューブなどでも 反応できる。
 Fastモードを使うことによって40分で反応を終えることが可能である。 6つのブロックゾーンで異なる温度を設定・運転することができる「VeriFlex」 ブロックが搭載されている。
 使用の際は機器施設HP 「主要機器の予約」 から予約してご使用ください。


予約制


設置場所:遺伝子解析室(5-501)

デジタルPCR(Bio-Rad社 QX100 Droplet Digital PCRシステム)

担当:森澤(PHS:36735)
Digital PCR

デジタルPCRは高精度高感度で絶対定量を行うことができます。測定にはFAM, VICラベルのプローブが必要です。 また、CNV解析、Rare sequence検出、遺伝子発現解析等に応用可能です。

設置場所:遺伝子解析室(2)(5-502)

マイクロアレイ(Affymetrix社 Gene Atlas)

担当:森澤(PHS:36735)
GeneAtlas

遺伝子発現の網羅的解析を行う。Affymetrix社製の解析ソフト群が入っている。


予約制


設置場所:遺伝子解析室(2)(5-502)

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